IF=58.7|肠-脑-肝轴新突破
肝硬化是各种慢性肝病的病理末期,是全球范围内导致严重疾病和死亡的主要原因,50-70%的肝硬化患者会发展为肝性脑病(HE),其发生与肠道菌群失调密切相关,但机制尚不明确。近日,南方医科大学珠江医院等研究团队在《Nature Medicine》上发表了标题为“The gut–brain axis underlying hepatic encephalopathy in liver cirrhosis”的文章,通过多组学联合分析,探究HE发病过程中的关键菌群、关键代谢物以及影响疾病进程的作用机制。
测序方法:宏基因组+代谢组+真核有参转录组+16s扩增子测序+qPCR
一、主要研究思路及结果
1、HE中关键菌、基因、代谢物的发现
实验:以下队列进行粪便宏基因组测序,血清代谢组分析。
分组
发现:来自Ruminococcus gnavus的苯丙氨酸脱羧酶(PDC)在LC中显著升高,代谢组分析发现源于R.gnavus的苯乙胺(PEA)在LC患者脑内积累,结合公开肝脏转录组数据分析显示:在肝硬化期间,R.gnavus的增加导致PEA在脑内的病理性积累,形成肠-肝硬化-脑轴。
图1 R.gnavus通过PDC诱导肝硬化小鼠HE样综合征
2、粪便移植实验验证PDC基因在HE中高表达
实验:为了探索来自HE个体的粪便微生物群的神经毒性潜力,进行粪便移植实验,收集小鼠粪便进行16S扩增子测序。
分组
发现:HE小鼠粪便中PDC基因丰度较高,导致PEA在脑内累积。与GF组相比,HE微生物群诱导了焦虑行为和记忆保留受损,而HC微生物群与GF组相比对行为改变无显著影响。中介分析表明,HE微生物群通过R. gnavus引起记忆缺陷。这些结果表明,
HE患者复杂的粪便菌群在HE发病机制中起着直接作用。
3、进一步探究PDC和PEA的作用机制
实验:为了全面解决HE患者粪便微生物群对大脑的分子效应,对接受HC、HE、PDCI(PDC抑制剂)处理的小鼠大脑皮层、海马、纹状体区域进行mRNA测序。
发现:HE患者的微生物群主要影响大脑皮层的整体基因表达,在PDCI处理后,这些异常基因重新正常化。
图2 靶向PDC可减轻HE患者粪便微生物群引起的神经毒性
4、探究人类HE队列中的肠道微生物PDC-PEA部分免疫学途径
实验:以下样本进行粪便宏基因组测序、血清代谢组分析以及qPCR测序。
发现:HE患者中的R.gnavus显著富集,qPCR结果发现从健康到肝硬化到HE患者PDC基因逐渐增加,HE患者血清PEA水平显著升高。相关性分析显示,细菌PDCs是导致HE患者PEA水平升高的原因。
5、纵向列队研究进一步确认PDC在HE中的作用
实验:研究纳入了一个经颈静脉肝内门静脉系统分流术(TIPS)队列,包括60名接受TIPS的患者。
发现:血清PEA较高的患者,TIPS手术后HE风险增加7倍。进一步证实了PEA和HE在临床队列中的因果关系,并提示PEA水平可能是TIPS手术后HE发病的警告标志。
图3 高PEA水平与TIPS后HE风险增加相关
二、讨论与思考
本研究通过多组学联合分析,发现HE与患者粪便中的R.gnavus通过PDC及其代谢物PEA有关,提升了人们对HE发病机制的了解,为HE的治疗和预防策略开辟了新的途径。同时,也为其他疾病发病机制的研究提供研究思路,除临床指标之外,还可以与肠道微生态进行关联。凌恩生物深耕微生态研究,已协助客户发表多篇文章,涉及疾病包括:大肠癌、肺癌、结直肠癌、食管鳞状细胞癌、糖尿病、多囊卵巢综合征、牙周炎等。
参考文献
The gut–brain axis underlying hepatic encephalopathy in liver cirrhosis.nature medicine,2025.
原文地址:https://blog.csdn.net/SHANGHAILINGEN/article/details/145267603
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