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SNP基因芯片基因分型1 - 解析SNP芯片各样本等位基因数据

本文介绍如何对SNP芯片数据进行解析,整理输SNP 、 chromosome、position三列+各样本对应的等位基因信息,用于后续介绍的基于SNP芯片的基因分型

1. 解析SNP芯片数据程序基本用法

# 运行方式, 默认dataType为ASA
# --input: 芯片原始结果文件路径
# --output: 输出结果文件路径
python parser_chip_data.py \
--input /path/XXX_ASA_v1_FinalReport_standard.txt \
--output /path/XXX_ASA_v1_FinalReport_standard_new.txt

2. 解析芯片数据脚本



原文地址:https://blog.csdn.net/LittleComputerRobot/article/details/145207291

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