DICOM图像解析:深入解析DICOM格式文件的高效读取与处理(续)
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PACS(Picture Archiving and Communication System)
RIS(Radiology Information System)
一、DICOM图像高效解析
在前面的文章中,我们已经介绍过了DICOM文件的基本结构、关键概念以及高效的读取与显示方法。为了进一步提升解析器的功能和性能,本文将在以下几个高级主题上进行详细探讨:
1、处理压缩的像素数据
医学影像数据通常具有较大的体积,为了节省存储空间和提高传输效率,DICOM标准支持多种压缩方法,如JPEG、JPEG2000、RLE等。解析压缩的像素数据需要相应的解压库或算法支持。
常见压缩算法及其处理方法
-
JPEG压缩:
- 特点:有损压缩,适用于彩色和灰度图像。
- 处理:使用如
System.Drawing
或第三方库(如ImageSharp
)进行解码。// 示例:使用System.Drawing解码JPEG压缩的像素数据 using (MemoryStream ms = new MemoryStream(pixelData)) { Image img = Image.FromStream(ms); // 进一步处理img }
-
JPEG2000压缩:
- 特点:支持有损和无损压缩,更高的压缩效率。
- 处理:需要专用库,如
OpenJPEG
或Kakadu
。
-
RLE压缩:
- 特点:无损压缩,适用于黑白图像。
- 处理:自定义实现或使用现有库解析RLE数据。
-
解压缩示例
以下是使用
fo-dicom
库处理压缩DICOM文件的示例代码:using Dicom; using Dicom.Imaging; // 读取DICOM文件 DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(filePath); // 解码像素数据 DicomImage dicomImage = new DicomImage(dicomFile.Dataset); Bitmap bitmap = dicomImage.RenderImage().AsClonedBitmap(); // 显示或处理bitmap pictureBox.Image = bitmap;
2、多帧图像的处理
DICOM文件中可能包含多帧图像,如动态扫描、三维图像等。处理多帧图像需要理解其内部结构,并进行相应的解析和显示。
多帧图像解析流程
1. 读取帧数信息:
标签(0028,0008)
表示帧数(Number of Frames)。
int numberOfFrames = int.Parse(tags["0028,0008"]);
2. 解析每一帧:
根据帧数,循环读取每一帧的像素数据,进行独立处理。
for (int frame = 0; frame < numberOfFrames; frame++)
{
// 计算当前帧的像素数据偏移
long currentFrameOffset = pixDataOffset + frame * singleFrameSize;
dicomFile.BaseStream.Seek(currentFrameOffset, SeekOrigin.Begin);
byte[] frameData = dicomFile.ReadBytes(singleFrameSize);
// 解码并处理frameData
}
3. 显示或存储多帧图像:
可以将多帧图像合成为动画、三维模型,或按需显示特定帧。
三维图像的体绘制
三维DICOM图像数据可用于体绘制(Volume Rendering),提供更加直观的解剖结构展示。常用的三维渲染库包括VTK
、Unity
的3D模块等。
3、序列和嵌套数据元素
DICOM支持复杂的数据结构,如序列(Sequence),这是嵌套数据元素的集合。处理这些结构需要递归解析,以保持数据的上下文关联。
序列数据的解析
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识别序列标签:
- 序列标签通常具有VR类型
SQ
(Sequence of Items),例如(0008,1032)
表示成像时间。
- 序列标签通常具有VR类型
-
解析序列项:
- 每个序列项包含一组数据元素,需递归解析。
private void ParseSequence(BinaryReader reader, uint length) {
- 每个序列项包含一组数据元素,需递归解析。
原文地址:https://blog.csdn.net/martian665/article/details/143620086
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