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文本处理三驾马车之Galaxy版awk

我们前面介绍了awk在Linux系统下的使用,见前文:

文本处理三驾马车之 awk

Galaxy 平台(UseGalaxy.cn)也整合了awk 工具,可以方便地对表格数据进行报表生成。

测试数据

  • UseGalaxy.cn > 数据共享 > 数据库 > Table data > iris.tsv,选定数据

  • 点击上方的 Add to History

  • 选择 as Datasets。

操作

工具:Text reformatting with awk (Galaxy Version 1.1.2)

筛选文件中第一列大于5的行:

  • File to process *:iris.tsv

  • AWK Program:NR > 1 && $1 > 5

结果显示:

2dc49f39825196b1823fd669f0097a87.png

筛选文件中第一列大于5的行,并且保留表头(第一行):

  • File to process *:iris.tsv

  • AWK Program:NR == 1 || $1 > 5

结果显示:

095ae58bcf72790af60de914b926c2dd.png

讨论

Galaxy平台只是整合了awk,为其提供界面化操作接口。至于awk命令的书写规范,跟其在Linux下的完全相同,如下图所示:

337be5f40e12c13600d8d8965f7115f6.png

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原文地址:https://blog.csdn.net/weshengxin/article/details/136384970

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