m1A-prediction
m1A-prediction
从牛津纳米孔直接RNA测序数据中定量分析N1-甲基腺苷（m1A）RNA甲基化
默认模型仅适用于ONT测序数据
Ⅰ. 模型下载和依赖安装
(1). 模型下载
用户可以直接使用以下命令下载模型：
wget https://github.com/BernieeeX/m1a-prediction/tree/main/models
(2). 依赖安装
ont_fast5_api 是一个用于处理牛津纳米孔技术（ONT）Fast5文件的Python API。
源代码：https://github.com/nanoporetech/ont_fast5_api
可以从源代码构建：
git clone https://github.com/nanoporetech/ont_fast5_api
pip install ./ont_fast5_api
pyguppyclient 是一个用于与牛津纳米孔技术（ONT）的Guppy服务器通信的Python客户端库。ONT的Guppy服务器是一个用于分析基因测序数据的服务器端软件，能够接收原始电信号数据并将其转换为DNA序列。
源代码：https://github.com/nanoporetech/pyguppyclient
pip install pyguppyclient
依赖列表：
源代码依赖
原文地址：https://blog.csdn.net/scuTim_Liu/article/details/143716678
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