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【3D Slicer】的小白入门使用指南十

3D Slicer肿瘤、囊性等多组织同步半自动分割勾画

任务

探讨肿瘤周围白质纤维在脑肿瘤切除神经外科计划中的应用

35岁,患有多发性胶质母细胞瘤 

 

 胶质母细胞瘤

  • 胶质母细胞瘤(GBM)是一种快速生长的高级别原发性胶质瘤。
  • 当前的治疗选择结合了手术、放疗和化疗。
  • GBM扩散到与运动功能、语言或视觉相关的关键区域。
     

 

 GBM手术

  • 脑肿瘤手术的目标是在保留关键白质纤维的同时,尽可能地切除肿瘤。
  • 由于肿瘤的浸润性,实现GBM手术中的完全切除是一个挑战。

图片由布里格姆和妇女医院的Alexandra Golby博士提供

 

脑外科手术中的扩散MRI

  • 扩散MRI能够无创地探索白质解剖
  • 纤维束成像技术可以在脑肿瘤切除手术规划中提供临床相关的信息。
     

 总体目标

本教程提供了一个端到端的解决方案,用于分割肿瘤轮廓并在病变附近生成白质纤维束。

 

步骤

工作流程概览

  • 步骤1:肿瘤分割
  • 步骤2:纤维束生成
  • 步骤3:交互式探索

图像处理工作流程

本教程描述的图像处理工作流程使用了三种算法:

● 用于肿瘤分割的生长切割算法Grow Cut

● 用于表面建模的Marching Cube算法

● 用于纤维束生成的单张量流线纤维束成像算法Single tensor streamline tractography

 总体目标

本教程提供了一个端到端的解决方案,用于分割肿瘤轮廓并在病变附近生成白质纤维束。
 

1、数据加载部分

教程材料

  • 3D Slicer,已经有了
  •  SlicerDMRI扩展,也有了
  • 白质探索数据集

 

教程数据包括一个基线体积和一个扩散张量成像&#


原文地址:https://blog.csdn.net/lj2048/article/details/143792706

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