PyRosetta protocol介绍及示例代码
在 Rosetta 和 PyRosetta 中，Protocols 是更高层次的操作，用于定义一系列步骤或组合操作（比如对接、设计、最小化等）。与单独的 Mover 和 Task 不同，Protocols 通常包含多个 Mover，并可能整合 Task 来实现更复杂的操作流程。Protocols 提供了高级别的接口来实现蛋白质建模、设计、对接等。
确实，大多数实现 Task 的 Mover 都会在 Protocols 中找到，原因是 Protocols 封装了 Task、Mover 和其他模块的组合，形成一整套操作流程。
以下是一些常见的 Protocols 及其在 PyRosetta 中的示例代码。
1. DockingProtocol
DockingProtocol 用于蛋白质-蛋白质或蛋白质-配体的对接操作。它封装了一系列对接操作步骤，包括刚体平移、旋转、打分和优化。
示例代码：蛋白质-蛋白质对接
import pyrosetta
from pyrosetta import rosetta
# 初始化 PyRosetta
pyrosetta.init()
# 加载两个 PDB 结构，作为两个对接分子
pose = pyrosetta.pose_from_pdb("input.pdb")
partner = py原文地址：https://blog.csdn.net/qq_27390023/article/details/142366645
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